Ученый совет Международного университета Джалал-Абада (МЮА) является высшим коллегиальным руководящим органом университета, обеспечивающим стратегическое руководство его образовательной, научной и инновационной деятельностью.

В состав Совета входят ректор (председатель), проректор по учебной работе (заместитель председателя), проректоры, руководители структурных подразделений, ведущие преподаватели, научные сотрудники и представители студенческого сообщества. Совет действует в соответствии с законодательством Кыргызской Республики и Уставом университета.

Основные обязанности Ученого совета включают:
— определение приоритетных направлений развития университета;
— утверждение учебных программ и планов исследований;
— анализ результатов исследований и их интеграция в образовательный процесс;

— принятие решений по подготовке научно-технического персонала;

— содействие международному сотрудничеству и академической мобильности;

— решение вопросов, связанных с повышением качества образования и научных исследований.

На своих заседаниях Ученый совет рассматривает ключевые вопросы деятельности университета, включая стратегическое планирование, аккредитацию академических программ, развитие научно-исследовательской инфраструктуры, а также меры по стимулированию научной и инновационной деятельности среди преподавателей и студентов.

Ученый совет играет решающую роль в обеспечении устойчивого развития университета, повышении его конкурентоспособности на национальном и международном уровнях и создании современной образовательной и научно-исследовательской среды.
Заседания и документация Ученого совета проводятся на государственном языке.