Учёный совет Жалал-Абадского международного университета (ЖАМУ) является высшим коллегиальным органом управления университетом, обеспечивающим стратегическое руководство образовательной, научной и инновационной деятельностью вуза.
В состав Учёного совета входят ректор (председатель), проректор по учебной работе (заместитель председателя), проректоры, руководители структурных подразделений, ведущие преподаватели, учёные, а также представители студенческого сообщества. Деятельность Совета осуществляется на основе действующего законодательства Кыргызской Республики и Устава университета.
Основными задачами Учёного совета являются:
     -определение приоритетных направлений развития университета;
     -утверждение образовательных программ и научно-исследовательских планов;
     -рассмотрение результатов научной деятельности и внедрение их в образовательный процесс;
     -принятие решений по вопросам подготовки научных и научно-педагогических кадров;
     -развитие международного сотрудничества и академической мобильности;
     -рассмотрение вопросов повышения качества образования и научной работы.
На заседаниях Учёного совета рассматриваются ключевые вопросы деятельности университета, включая стратегическое планирование, аккредитацию образовательных программ, развитие научной инфраструктуры, а также вопросы стимулирования научной и инновационной активности преподавателей и обучающихся и др..
Учёный совет играет важную роль в обеспечении устойчивого развития университета, повышении его конкурентоспособности на национальном и международном уровнях, а также в формировании современной образовательной и научной среды.
Заседания и документация ученого совета осуществяется на государственном языке